小智一行人在某个草原上发现了受伤的神奇宝贝，靠过去一看才发现那是火箭队的喵喵。疗伤时询问缘由才知道，它是在城镇外围一座叫作多多罗铁工厂的巨大建筑物里，被银河队打倒的，武藏小次郎还有国际刑警帅哥都被抓住了。小智等人决定与喵喵一起潜入多多罗铁工厂。