小智得到了第三个缎带勋章，为了前往下一个道馆所在的绿岭市，一行人搭上了连络船班。然而他们不知自己搞错了目的地，这艘船其实是到达邦巴岛的。在那里，小智等人遇到了带着妙蛙草、卡咪龟、火恐龙的少年吉米。吉米正在神奇宝贝比赛裁判养成学校学习如何当裁判。受养成学校老师莎莉娜所托，小智与小刚加入了学生们的双打比赛实习课。