小智一行人终于抵达随意镇了，就在为神奇宝贝华丽大赛随意大会进行特训的时候，小光的青梅竹马健悟出现了。健悟正好要前往随意遗迹，跟着他一起走的小智一行人，在祭祀帝牙卢卡与帕路奇犽的遗迹前展开对战。而在同一时间，遗迹内部正在进行某种可疑的仪式。突然之间，象徵神奇宝贝未知图腾开始暴动，遗迹发生了异变。