帮忙双叶祭典活动的小智一行人，正在镇上四处逛摊位的时候，阿驯出现了。与小光一样住在双叶镇的阿驯，也是为了双叶祭典回来。久违重逢小智与阿驯决定进行对战，在帝王拿波与皮卡丘展开激战的时候，阿驯突然发现在天上飞行着精灵神奇宝贝天然鸟。大家跟着追去，天然鸟带他们来到的地方竟然是个马戏团。