小智一行人在旅途中经过的城镇发现一只夹在建筑物缝隙中的玛力露。大家急忙救出它之后，它的训练家正好找来。这名戴着令人印象深刻白帽子的少女叫做琴音，她是为了在这个城镇举办的特展，与名叫一成的少年一起从城都地方来的。琴音的伙伴是叶神奇宝贝菊草叶，一成的则是大颚神奇宝贝小锯鳄。