红豆杉博士的父亲发现了与被称为传说的神奇宝贝雷希拉姆有关的地点白色遗迹，小智等人为了前往白色遗迹踏上了新的旅程。他们乘船发现停靠点附近有一座废墟，那里曾是一座实验室，大家都很好奇那个实验室研究的内容是什么。到了停靠点，小智很兴奋的准备下船，却发现岸边一个戴帽子的男生一直盯着他们看…