小智一行人坐船到关都地方的港口城市枯叶市，在杰可罗拉群岛旅行的日子也即将结束。火箭队想在小智他们到达关都之前捉走皮卡丘，他们用巨型的气球把客船吊起，让船上乘客陷入了恐慌。火箭队这次的计谋能否成功夺走小智他们的神奇宝贝吗？而且这次帕卡先生竟然加入火箭队一起捣乱，这究竟是怎么回事呢？