小智到达了关都地方的枯叶市，环绕杰可罗拉群岛的旅行终于告一段落。小智跟艾莉丝和天桐告别，各自向自己的梦想进发。小智和三色堇一起回到真新镇，在回家不久后立即前往大木博士的研究所与神奇宝贝们见面。小智回顾了在合众地方的冒险，决定前往卡洛斯地方，实现自己成为神奇宝贝大师的梦想。